A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | |
№ пробирки | № в коллекции | Вид в коллекции | BLAST ближайшее сходство | Имя исходного файла | Последовательность | % BLAST | BLAST closest ID | TYPE specimen | GenBankID | Seq_Qual_Remarks | Work_remarks | |
173 | YSU-F-12619 | Lentinus castoreus | Lentinellus sublineolatus | 173_ITS_F_A09_01_2022-10-06-23-24-52.ab1 | seq | 99.4 | NR_119505.1 | TENN:059307 | OQ450397 | хороший | короткий, сделать обратный | |
173 | YSU-F-12619 | Lentinus castoreus | Lentinellus sublineolatus | 173_ITS_R_A08_01_2023-02-15-16-27-33.ab1 | хороший | |||||||
174 | YSU-F-12628 | Hypsizygus ulmarius | Hypsizygus marmoreus | 174_ITS_F_B09_02_2022-10-06-23-24-52.ab1 | seq | 99.0 | OP980886.1 | OQ450398 | хороший | короткий, сделать обратный | ||
174 | YSU-F-12628 | Hypsizygus ulmarius | Hypsizygus marmoreus | 174_ITS_R_B08_02_2023-02-15-16-27-33.ab1 | хороший | |||||||
175 | YSU-F-12594 | Cortinarius adustoremosus | Cortinarius adustorimosus | 175_ITS_F_C09_03_2022-10-06-23-24-52.ab1 | seq | 99.0 | NR_172319.1 | PC:R. Henry 883 | OQ450391 | хороший | короткий, сделать обратный | |
175 | YSU-F-12594 | Cortinarius adustoremosus | Cortinarius adustorimosus | 175_ITS_R_A07_01_2023-02-14-17-16-01.ab1 | хороший |
A | B | |
Sequence_ID | Идентификатор сиквенса, должен совпадать с названием сиквенса в фаста файле (YSU-F-12594) | |
Organism | Название таксона на латыни (Cortinarius adustorimosus) | |
Specimen-Voucher | Номер ваучерного образца (YSU-F-12594) | |
Country | Страна (Russia) | |
Latitude-Longitude | Широта и долгота в формате (61.04119 N 69.31318 E) | |
Collection-Date | Дата сбора образца (03.10.2023) | |
Collected-By | Автор находки (Bulyonkova, Tatiana) | |
Fwd-Primer-Name | Название прямого праймера (ITS1-F) | |
Rev-Primer-Name | Название обратного праймера (ITS4) | |
Fwd-Primer-Seq | Последовательность прямого праймера | |
Rev-Primer-Seq | Последовательность обратного праймера |
A | B | |
Название поля в Specify | Название для импорта в IPT | |
Cat number | occurrenceID | |
Primer Name Forward | pcr_primer_forward | |
Primer Seq Forward | pcr_primer_reverse | |
Primer Name Rev | pcr_primer_name_forward | |
Primer Seq Rev | pcr_primer_name_reverse | |
Primer Ref Cit Forward | pcr_primer_reference | |
Genbank Accession Number | url | |
Gene Sequence | DNA_sequence | |
Seq type | seq_meth | |
Target Marker | target_gene |